MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Capnocytophaga ochracea DSM 7271 chromosome

Total Repeats: 9116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013162	GAA	2	6	27	32	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013162	GAA	2	6	90	95	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013162	AAT	2	6	99	104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013162	AG	3	6	113	118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013162	ATAA	2	8	212	219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013162	GAAC	2	8	232	239	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013162	GAAC	2	8	243	250	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013162	GAAC	2	8	254	261	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_013162	GAAC	2	8	265	272	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013162	GAAC	2	8	353	360	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013162	ACGA	2	8	366	373	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013162	ACGA	2	8	388	395	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_013162	TAG	2	6	465	470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013162	AAAG	2	8	581	588	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013162	AT	4	8	614	621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013162	TA	3	6	642	647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013162	A	6	6	653	658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013162	ATT	2	6	685	690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013162	T	6	6	689	694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013162	AAAC	2	8	712	719	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013162	TCA	2	6	720	725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013162	ATT	2	6	2637	2642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013162	A	6	6	2643	2648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013162	GAG	2	6	4805	4810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013162	TAT	2	6	4911	4916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013162	AT	3	6	4915	4920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013162	ACC	2	6	4931	4936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_013162	ATA	2	6	4966	4971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013162	TCTTTA	2	12	6243	6254	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_013162	AGA	2	6	6257	6262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013162	AAT	2	6	6277	6282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013162	T	6	6	6304	6309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013162	A	6	6	6328	6333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013162	A	7	7	6338	6344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013162	ATA	2	6	6353	6358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013162	ATT	2	6	6388	6393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013162	A	7	7	6486	6492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013162	AAT	2	6	10121	10126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013162	A	7	7	10134	10140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013162	ATG	2	6	10443	10448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013162	TAAA	2	8	10463	10470	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013162	CTT	2	6	10548	10553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013162	T	7	7	10568	10574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013162	TAA	2	6	11072	11077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013162	TTTG	2	8	11097	11104	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013162	TAA	2	6	11189	11194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013162	ATT	2	6	11202	11207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013162	AT	3	6	12200	12205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013162	GAA	2	6	12280	12285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013162	A	8	8	12284	12291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013162	T	8	8	12292	12299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013162	CAT	2	6	12313	12318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013162	T	7	7	12396	12402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013162	CAA	2	6	12512	12517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013162	T	6	6	12629	12634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013162	A	6	6	12640	12645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013162	TAA	2	6	15525	15530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013162	GTTT	2	8	15531	15538	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013162	AT	3	6	15561	15566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013162	T	6	6	15580	15585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013162	TATT	2	8	15588	15595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013162	A	6	6	17130	17135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013162	CTT	2	6	17161	17166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013162	T	7	7	17165	17171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013162	CAAA	2	8	17205	17212	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013162	GATT	2	8	18834	18841	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013162	TTAAT	2	10	19464	19473	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013162	AG	3	6	19507	19512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013162	A	7	7	19528	19534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013162	TGA	2	6	19566	19571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013162	AAT	2	6	20334	20339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013162	A	7	7	20353	20359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013162	AT	3	6	20392	20397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013162	CTA	2	6	20456	20461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013162	AAG	2	6	22403	22408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013162	AGG	3	9	22486	22494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013162	ACG	2	6	22524	22529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013162	ATAA	2	8	22554	22561	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013162	ATG	2	6	22595	22600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013162	ATG	2	6	22617	22622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013162	GAA	2	6	22677	22682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013162	GAAC	2	8	22717	22724	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013162	GAAC	2	8	22728	22735	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_013162	GAA	2	6	22765	22770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013162	ATAAA	2	10	22780	22789	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013162	ATATA	2	10	22802	22811	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013162	GTT	2	6	22875	22880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013162	T	6	6	22890	22895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013162	T	7	7	22928	22934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013162	ATT	2	6	22992	22997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013162	ATT	2	6	25887	25892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013162	T	6	6	25891	25896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013162	CAT	2	6	25904	25909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_013162	AAT	2	6	28257	28262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013162	AAT	2	6	28266	28271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013162	TA	3	6	28277	28282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013162	TTAA	2	8	28297	28304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013162	TTA	2	6	28317	28322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013162	A	6	6	30143	30148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013162	ATT	2	6	30154	30159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013162	AAC	2	6	31607	31612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013162	T	6	6	31637	31642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013162	TTA	2	6	31653	31658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013162	CTT	2	6	31687	31692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013162	A	7	7	31713	31719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013162	T	7	7	31734	31740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013162	TAA	2	6	31743	31748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013162	TAA	2	6	31786	31791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013162	TC	3	6	31834	31839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013162	TA	3	6	33043	33048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013162	CTTT	2	8	33083	33090	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_013162	GTATT	2	10	34983	34992	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013162	GTT	2	6	35003	35008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013162	TA	3	6	36044	36049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013162	ATT	2	6	36062	36067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013162	AGT	2	6	36078	36083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013162	T	6	6	36083	36088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013162	ATA	2	6	36125	36130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013162	T	7	7	36160	36166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013162	ATG	2	6	36197	36202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013162	AAAT	2	8	36215	36222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013162	TAA	2	6	36230	36235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013162	TAT	2	6	36251	36256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013162	TCA	2	6	36298	36303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013162	TCAACT	2	12	36385	36396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_013162	CTTC	2	8	36418	36425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_013162	GTTC	2	8	36510	36517	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_013162	GTTC	2	8	36521	36528	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_013162	ATT	2	6	36735	36740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013162	CCCCCA	2	12	36746	36757	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
131	NC_013162	TAT	2	6	36876	36881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013162	TAT	2	6	36885	36890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013162	ATTA	2	8	36905	36912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013162	TAA	2	6	37313	37318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013162	A	6	6	37317	37322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013162	TTA	2	6	49253	49258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013162	TA	3	6	49267	49272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013162	TAT	2	6	49301	49306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013162	T	11	11	49337	49347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013162	CAT	2	6	49355	49360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_013162	TA	3	6	49366	49371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013162	A	8	8	49390	49397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013162	T	6	6	49473	49478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013162	CTTTT	2	10	49491	49500	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_013162	AAATA	2	10	49506	49515	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013162	AAT	2	6	49523	49528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013162	ATA	2	6	49543	49548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013162	TTAAA	2	10	49576	49585	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013162	AAG	2	6	49686	49691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013162	CGA	2	6	49781	49786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_013162	CTAC	2	8	49788	49795	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_013162	T	8	8	49834	49841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013162	T	6	6	49853	49858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013162	TAT	2	6	49862	49867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_013162	T	6	6	49867	49872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_013162	TTA	2	6	51756	51761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_013162	T	6	6	51785	51790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_013162	T	8	8	97483	97490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_013162	A	7	7	97500	97506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_013162	GTA	2	6	103362	103367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_013162	ATT	2	6	148944	148949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_013162	ATT	2	6	148996	149001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_013162	T	6	6	150861	150866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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454	NC_013162	ATT	2	6	150912	150917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_013162	A	6	6	158153	158158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_013162	CTGC	2	8	160131	160138	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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